此病的病因有多种说法，真正认识此病，需要多角度思考，需要多领域知识。首先，该病多发生在雏鸡7日龄免疫后，常出现零星尖叫、瘫痪、共济失调等症状，排出肉色带肠黏膜的粪便，继而出现死亡的鸡只；10日龄~14日龄后逐渐增多，高的日死亡率常可达到1%。

    由于各地环境、饲养管理和药物预防水平不同，造成球虫感染导致消化功能障碍，肠道微生态平衡被破坏，引起厌氧菌感染，进一步恶化了消化道内环境使菌群失调，肠道内有益菌减少，而有害菌趁机大量繁殖，肠道消化酶的消化功能下降，饲料消化不良，有害菌、球虫及其产物刺激肠道的平滑肌收缩，使肠蠕动加快、加强，饲料消化时间减少，导致过料。而后继发病毒等使病症加重，造成该病暴发，大批量死亡。

    分析认为，疫苗接种应激应该是该病的诱因，而球虫和有害菌活动产生的毒素和梭菌产生的外毒素造成了鸡只的神经症状和肝肾的充血和肿胀。因此该病的治疗应该首先提高免疫力抗应激，然后同时控制小肠球虫和坏死性肠炎。

    正确认识“肠毒综合征”之后，我们还要注意几方面的事宜。首先，“肠毒综合征”死亡率高的原因不在于腹泻，而是自体中毒，因此强制止泻反而加剧了自体中毒，死亡不降反升，或者投药数天效果不佳，所以应该引导排毒而不是一味止泻。再者，此时鸡体肠道吸收能力较差，用一般多维会造成鸡没有吸收反而促进了球虫和有害菌的繁殖。建议用纳米工艺生产的“维多利”来补充鸡体营养。最后尽量不要拌料投药，因为病鸡的食欲较差，不能吃到足够的药量而使治疗效果不佳。

    治疗时配合黄芪多糖成分的增强免疫力的药物，如用“恒杰康”拌料，上午用“新大肠杆菌特号”（肠毒药），下午用“速服康”（球虫药），间隙饮“维多利”和葡萄糖水，晚上通肾。同时加强饲养管理，做好卫生、消毒工作，防止其他继发感染的发生。