烤烟是特殊的经济作物，对其生长的土壤营养环境有着特殊的要求。多年来的科学和生产实践经验表明，烤烟种植应该进行轮作，并且前后作的作物轮换顺序合理，才能达到既提高烟叶产质量又维持土壤肥力目的。
　　
   烤烟连作的不良后果：烤烟连作会导致烟株瘦小、生长速度缓慢，烟叶产量质量下降，烟叶成熟度变差。烤后烟叶叶片组织结构紧密，颜色灰暗，油分少，烟叶可用性下降。烤烟连作会导致烟田病害虫害危害严重。烤烟连作田黑胫病、根黑腐病、根结线虫和赤星病的发病率升高。
　　
   1.连作烟田病虫危害加重，轮作可使病虫害减轻

　　严重影响烤烟产质量的病害如病毒病、猝倒病、野火病、黄瓜花叶病、黑胫病、根黑腐病、根结线虫病、炭疽病、赤星病等，害虫类的蚜虫、烟青虫、斜纹夜蛾、小地老虎等，都有可能残留在烟株残体或其他寄主上，并成为下一年种植烤烟的病虫初侵染源。生产实践证明，烤烟轮作田块病虫危害减轻，其主要原因就是轮作切断了病虫初侵染源。烟草的许多病虫是通过土壤传播，但每种病害都有一定的寄主，有的害虫只能危害一种或几种作物，如果多年种植连续种植烟草，危害烟草的病虫就会大量滋生。但是病菌在土壤中的生存能力都有一定的期限，在这期间如果遇不到它们生存的寄主，就会逐年消失或者达不到一定的数量不能引起烟草发病的程度。因此，抗病作物、非寄主作物与容易感染这些病虫的作物实行定期轮作，便可消灭或减少这些病菌在土壤中的数量。从而使病虫危害减轻。

　　2.连作烟田土壤养分不平衡、肥效降低，轮作可提高肥料利用率

　　不同作物从土壤中吸取的养分数量和比例不同，连作打破了土壤中养分的平衡，使一些营养元素在土壤中残留较多，如：n、b、p、ca、fe、mn等，另外一些营养元素相对缺乏，如：k、mg、zn、mo等，因此，烟株难以正常生长发育，抗病性下降，由于元素间拮抗作用的存在，因而肥料利用率低，肥效降低；连作与轮作土壤养分对比结果表明：连作田土壤中的有效磷和有效钾含量明显地高于轮作田；轮作土壤的ph值、有机质、全钾、速效硼、速效锌、cec、交换性镁均高于连作土壤。将烟草与其他作物轮作，能全面而均衡地利用土壤中的营养元素，能充分发挥肥效。

　　栽培的农作物有浅根作物和深根作物，在土壤中的吸水吸肥空间范围不同。深根如小麦、玉米、黄豆和浅根作物烤烟轮作，可充分利用土壤中的养分和水分，减少肥料流失，从而节省肥料。

　　年度间不同作物实行轮作，尤其是水旱轮作，能改善土壤通气条件，能大幅度减少烤烟病虫害，利于有益根际微生物的繁殖。特别是与禾本科作物和绿肥轮作，绿肥和禾本科秸秆还田可增加土壤有机质，改善土壤通透性。

　　3.连作烟田烟叶产量下降，烟叶质量下降，效益很差

　　由于连作使根的吸收能力减弱，土壤营养供给失衡，在烟叶产量降低的同时，质量也随之下降。连作田烟株的田间长相长势、产量、产值、外观质量均低于轮作；据测定，连作田的产量仅有轮作田的59.12%；产值仅有轮作的29.93%；中上等烟比例仅有轮作的52.07%；均价仅有50.6%。

　　4．连作加大化肥、农药和劳动力的投入，合理轮作能减少投入

　　由于连作病虫危害严重，从而增加化学农药的投入；由于连作，有机质含量逐年减少，土壤养分严重失调，微量元素含量逐年降低。长期连作的田块，必须施用大量的肥料，烟株才能长起来，但生产出的烟叶质量差。

　　连作烟田病虫抗药性增强，从而使病虫产生再猖獗；因此化学农药的用量也随之加大。烟草实行合理轮作，病虫危害会大幅度降低，田间烟株的农药施用量和用药次数就会减少，土壤内的农药残用量和烟叶所含农药残留量就相对减少，降低残留农药对烟叶和土壤环境的污染。

　　5．烤烟与其它作物的轮作顺序

　　烤烟尽量避免选择茄科作物和葫芦科作物和蔬菜地作为前作。可选择水稻、玉米、麦类、豆类、高梁等作物与烟草轮作，最好是选择水旱轮作。美国的烤烟，一般是烟草—棉花（大豆）—牧草—烟草，3年一个轮回轮作。
　　
   禾本科作物是烟草前作的最佳前作，禾本科作物从土壤中吸收的氮素较多，而磷、钾相对较少，利于烤烟的养分平衡。
　　
   目前主要采用的轮作制度有以几种：

　　（1）水旱轮作：主要在生产水稻的坝区和部分河谷地区。

　　三年六熟轮作制：第一年：烤烟一油菜（麦类、蚕豆）→第二年：水稻一麦类（蚕豆、油菜、绿肥）→第三年：水稻一麦类（蚕豆、油菜、绿肥）。

　　两年四熟轮作制：第一年：烤烟一油菜（麦类、蚕豆）→第二年：水稻一蚕豆（麦类、油菜、绿肥）

　　（2）旱地轮作制度：地烟的主要轮作制度。

　　三年六熟轮作制：第一年：烤烟一油菜（麦类、绿肥）→第二年：玉米一麦类（蚕豆、油菜、绿肥）→第三年：玉米（红薯，豆类）一麦类（蚕豆、油菜、杂粮或休闲）。